Protein–RNA interactions for Protein: Q99PA7

4930550L24Rik, MCG117379, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930550L24RikQ99PA7 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
4930550L24RikQ99PA7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
4930550L24RikQ99PA7 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4930550L24RikQ99PA7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4930550L24RikQ99PA7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms