Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE9

Pbx4, Pre-B-cell leukemia transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbx4Q99NE9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pbx4Q99NE9 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pbx4Q99NE9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbx4Q99NE9 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbx4Q99NE9 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbx4Q99NE9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbx4Q99NE9 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbx4Q99NE9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pbx4Q99NE9 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbx4Q99NE9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbx4Q99NE9 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbx4Q99NE9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pbx4Q99NE9 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pbx4Q99NE9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pbx4Q99NE9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pbx4Q99NE9 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pbx4Q99NE9 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66 ms