Protein–RNA interactions for Protein: Q99NE5

Rims1, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims1Q99NE5 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rims1Q99NE5 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rims1Q99NE5 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rims1Q99NE5 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rims1Q99NE5 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rims1Q99NE5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rims1Q99NE5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rims1Q99NE5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Rims1Q99NE5 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Rims1Q99NE5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rims1Q99NE5 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Rims1Q99NE5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.32■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rims1Q99NE5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 285.9 ms