Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB1

Acss1, Acetyl-coenzyme A synthetase 2-like, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acss1Q99NB1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Acss1Q99NB1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Acss1Q99NB1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acss1Q99NB1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acss1Q99NB1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acss1Q99NB1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Acss1Q99NB1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acss1Q99NB1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acss1Q99NB1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acss1Q99NB1 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acss1Q99NB1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acss1Q99NB1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acss1Q99NB1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acss1Q99NB1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acss1Q99NB1 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Acss1Q99NB1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acss1Q99NB1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acss1Q99NB1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acss1Q99NB1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acss1Q99NB1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Acss1Q99NB1 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms