Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Nmd3Q99L48 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Nmd3Q99L48 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nmd3Q99L48 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nmd3Q99L48 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms