Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Vmp1Q99KU0 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Vmp1Q99KU0 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Vmp1Q99KU0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Vmp1Q99KU0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms