Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ0

Ubxn2a, UBX domain-containing protein 2A, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2aQ99KJ0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn2aQ99KJ0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn2aQ99KJ0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn2aQ99KJ0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn2aQ99KJ0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn2aQ99KJ0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn2aQ99KJ0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn2aQ99KJ0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ubxn2aQ99KJ0 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ubxn2aQ99KJ0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ubxn2aQ99KJ0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ubxn2aQ99KJ0 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ubxn2aQ99KJ0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ubxn2aQ99KJ0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms