Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Usp11Q99K46 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usp11Q99K46 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usp11Q99K46 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp11Q99K46 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp11Q99K46 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp11Q99K46 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp11Q99K46 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usp11Q99K46 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp11Q99K46 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp11Q99K46 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usp11Q99K46 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usp11Q99K46 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms