Protein–RNA interactions for Protein: Q99JX7

Nxf1, Nuclear RNA export factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf1Q99JX7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Nxf1Q99JX7 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Nxf1Q99JX7 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nxf1Q99JX7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nxf1Q99JX7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85.7 ms