Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR8

Smarcd2, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd2Q99JR8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smarcd2Q99JR8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smarcd2Q99JR8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smarcd2Q99JR8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms