Protein–RNA interactions for Protein: Q99JN2

Klhl22, Kelch-like protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl22Q99JN2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Klhl22Q99JN2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Klhl22Q99JN2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl22Q99JN2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl22Q99JN2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl22Q99JN2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl22Q99JN2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl22Q99JN2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl22Q99JN2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl22Q99JN2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl22Q99JN2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl22Q99JN2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl22Q99JN2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Klhl22Q99JN2 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klhl22Q99JN2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klhl22Q99JN2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Klhl22Q99JN2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Klhl22Q99JN2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Klhl22Q99JN2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klhl22Q99JN2 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klhl22Q99JN2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Klhl22Q99JN2 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms