Protein–RNA interactions for Protein: Q99JH7

Clstn3, Calsyntenin-3, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn3Q99JH7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Clstn3Q99JH7 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Clstn3Q99JH7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Clstn3Q99JH7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.2 ms