Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ctu1Q99J10 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ctu1Q99J10 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ctu1Q99J10 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ctu1Q99J10 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms