Protein–RNA interactions for Protein: Q99388

Csprs, Component of Sp100-rs, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CsprsQ99388 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CsprsQ99388 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
CsprsQ99388 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CsprsQ99388 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CsprsQ99388 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CsprsQ99388 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CsprsQ99388 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CsprsQ99388 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CsprsQ99388 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CsprsQ99388 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CsprsQ99388 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CsprsQ99388 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms