Protein–RNA interactions for Protein: Q96EQ9

Prdm9, Histone-lysine N-methyltransferase PRDM9, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm9Q96EQ9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Prdm9Q96EQ9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Prdm9Q96EQ9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Prdm9Q96EQ9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms