Protein–RNA interactions for Protein: Q924Y0

Bbox1, Gamma-butyrobetaine dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbox1Q924Y0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Bbox1Q924Y0 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Bbox1Q924Y0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Bbox1Q924Y0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Bbox1Q924Y0 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms