Protein–RNA interactions for Protein: Q924D0

Rtn4ip1, Reticulon-4-interacting protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4ip1Q924D0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Rtn4ip1Q924D0 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rtn4ip1Q924D0 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Rtn4ip1Q924D0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms