Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Csmd1Q923L3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Csmd1Q923L3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Csmd1Q923L3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
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