Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Sf3b5Q923D4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sf3b5Q923D4 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Sf3b5Q923D4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Sf3b5Q923D4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms