Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sf3b3Q921M3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Sf3b3Q921M3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sf3b3Q921M3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms