Protein–RNA interactions for Protein: Q920R0

Als2, Alsin, mousemouse

Predictions only

Length 1,651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Als2Q920R0 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Als2Q920R0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Als2Q920R0 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Als2Q920R0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Als2Q920R0 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Als2Q920R0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Als2Q920R0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Als2Q920R0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Als2Q920R0 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Als2Q920R0 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Als2Q920R0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Als2Q920R0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Als2Q920R0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Als2Q920R0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Als2Q920R0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Als2Q920R0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Als2Q920R0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Als2Q920R0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Als2Q920R0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Als2Q920R0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Als2Q920R0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Als2Q920R0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Als2Q920R0 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Als2Q920R0 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Als2Q920R0 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Als2Q920R0 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Als2Q920R0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 214.3 ms