Protein–RNA interactions for Protein: Q920N2

Hlcs, Biotin--protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlcsQ920N2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
HlcsQ920N2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HlcsQ920N2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
HlcsQ920N2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HlcsQ920N2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HlcsQ920N2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HlcsQ920N2 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HlcsQ920N2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HlcsQ920N2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HlcsQ920N2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms