Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med28Q920D3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Med28Q920D3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Med28Q920D3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms