Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slc5a4bQ91ZP4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Slc5a4bQ91ZP4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slc5a4bQ91ZP4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Slc5a4bQ91ZP4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Slc5a4bQ91ZP4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms