Protein–RNA interactions for Protein: Q91YR7

Prpf6, Pre-mRNA-processing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf6Q91YR7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Prpf6Q91YR7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Prpf6Q91YR7 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Prpf6Q91YR7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Prpf6Q91YR7 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 253.3 ms