Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atl3Q91YH5 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC26.76■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Atl3Q91YH5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Atl3Q91YH5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atl3Q91YH5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atl3Q91YH5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atl3Q91YH5 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atl3Q91YH5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Atl3Q91YH5 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atl3Q91YH5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atl3Q91YH5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Atl3Q91YH5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Atl3Q91YH5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atl3Q91YH5 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atl3Q91YH5 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Atl3Q91YH5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Atl3Q91YH5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atl3Q91YH5 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atl3Q91YH5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Atl3Q91YH5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Atl3Q91YH5 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Atl3Q91YH5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atl3Q91YH5 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Atl3Q91YH5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Atl3Q91YH5 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atl3Q91YH5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atl3Q91YH5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atl3Q91YH5 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atl3Q91YH5 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Atl3Q91YH5 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atl3Q91YH5 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atl3Q91YH5 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Atl3Q91YH5 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Atl3Q91YH5 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms