Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y11

Pcdha9, Protocadherin alpha-9, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha9Q91Y11 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pcdha9Q91Y11 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pcdha9Q91Y11 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pcdha9Q91Y11 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Pcdha9Q91Y11 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms