Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lims2Q91XD2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Lims2Q91XD2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Lims2Q91XD2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lims2Q91XD2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lims2Q91XD2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lims2Q91XD2 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lims2Q91XD2 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Lims2Q91XD2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lims2Q91XD2 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Lims2Q91XD2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Lims2Q91XD2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lims2Q91XD2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lims2Q91XD2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Lims2Q91XD2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lims2Q91XD2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lims2Q91XD2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lims2Q91XD2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lims2Q91XD2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms