Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Usp3Q91W36 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Usp3Q91W36 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Usp3Q91W36 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms