Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIK1

Snrnp25, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 25 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp25Q8VIK1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snrnp25Q8VIK1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Snrnp25Q8VIK1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snrnp25Q8VIK1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms