Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG1

Rest, RE1-silencing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RestQ8VIG1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RestQ8VIG1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RestQ8VIG1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RestQ8VIG1 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RestQ8VIG1 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
RestQ8VIG1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
RestQ8VIG1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
RestQ8VIG1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RestQ8VIG1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
RestQ8VIG1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
RestQ8VIG1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
RestQ8VIG1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
RestQ8VIG1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RestQ8VIG1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RestQ8VIG1 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RestQ8VIG1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
RestQ8VIG1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RestQ8VIG1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RestQ8VIG1 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RestQ8VIG1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RestQ8VIG1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RestQ8VIG1 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RestQ8VIG1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RestQ8VIG1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RestQ8VIG1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RestQ8VIG1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RestQ8VIG1 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RestQ8VIG1 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RestQ8VIG1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RestQ8VIG1 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RestQ8VIG1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RestQ8VIG1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RestQ8VIG1 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RestQ8VIG1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms