Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHS2

Crb1, Protein crumbs homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crb1Q8VHS2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
Crb1Q8VHS2 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Crb1Q8VHS2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Crb1Q8VHS2 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Crb1Q8VHS2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.58■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Crb1Q8VHS2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms