Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHI4

Carf, Calcium-responsive transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CarfQ8VHI4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CarfQ8VHI4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CarfQ8VHI4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CarfQ8VHI4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms