Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEG0

Ccdc71, Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71Q8VEG0 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc71Q8VEG0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ccdc71Q8VEG0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Ccdc71Q8VEG0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ccdc71Q8VEG0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.2 ms