Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sgip1Q8VD37 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sgip1Q8VD37 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Sgip1Q8VD37 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sgip1Q8VD37 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sgip1Q8VD37 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Sgip1Q8VD37 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sgip1Q8VD37 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sgip1Q8VD37 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sgip1Q8VD37 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Sgip1Q8VD37 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sgip1Q8VD37 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Sgip1Q8VD37 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sgip1Q8VD37 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sgip1Q8VD37 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sgip1Q8VD37 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Sgip1Q8VD37 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sgip1Q8VD37 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Sgip1Q8VD37 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Sgip1Q8VD37 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sgip1Q8VD37 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sgip1Q8VD37 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Sgip1Q8VD37 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Sgip1Q8VD37 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sgip1Q8VD37 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sgip1Q8VD37 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Sgip1Q8VD37 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.7 ms