Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Fam20bQ8VCS3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Fam20bQ8VCS3 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Fam20bQ8VCS3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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