Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ubxn4Q8VCH8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ubxn4Q8VCH8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ubxn4Q8VCH8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ubxn4Q8VCH8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.4 ms