Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH2

Cd300ld, CMRF35-like molecule 5, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300ldQ8VCH2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cd300ldQ8VCH2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cd300ldQ8VCH2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cd300ldQ8VCH2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms