Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCE1

Dnajc28, DnaJ homolog subfamily C member 28, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc28Q8VCE1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dnajc28Q8VCE1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dnajc28Q8VCE1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Dnajc28Q8VCE1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Dnajc28Q8VCE1 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms