Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW6

Nae1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, mousemouse

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nae1Q8VBW6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nae1Q8VBW6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Nae1Q8VBW6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 85 ms