Protein–RNA interactions for Protein: Q8R570

Snap47, Synaptosomal-associated protein 47, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap47Q8R570 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Snap47Q8R570 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Snap47Q8R570 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snap47Q8R570 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snap47Q8R570 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms