Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4B8

Nlrp3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,033 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp3Q8R4B8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nlrp3Q8R4B8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nlrp3Q8R4B8 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Nlrp3Q8R4B8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nlrp3Q8R4B8 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nlrp3Q8R4B8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nlrp3Q8R4B8 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nlrp3Q8R4B8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Nlrp3Q8R4B8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nlrp3Q8R4B8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nlrp3Q8R4B8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Nlrp3Q8R4B8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms