Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2S1

Rps6kl1, Ribosomal protein S6 kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6kl1Q8R2S1 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rps6kl1Q8R2S1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Rps6kl1Q8R2S1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Rps6kl1Q8R2S1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms