Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0F3

Sumf1, Sulfatase-modifying factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sumf1Q8R0F3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Sumf1Q8R0F3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sumf1Q8R0F3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sumf1Q8R0F3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sumf1Q8R0F3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sumf1Q8R0F3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sumf1Q8R0F3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sumf1Q8R0F3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sumf1Q8R0F3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sumf1Q8R0F3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sumf1Q8R0F3 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Sumf1Q8R0F3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sumf1Q8R0F3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms