Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZT2

Ccsap, Centriole, cilia and spindle-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 252 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcsapQ8QZT2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcsapQ8QZT2 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CcsapQ8QZT2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcsapQ8QZT2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcsapQ8QZT2 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CcsapQ8QZT2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcsapQ8QZT2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcsapQ8QZT2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcsapQ8QZT2 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcsapQ8QZT2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcsapQ8QZT2 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CcsapQ8QZT2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CcsapQ8QZT2 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CcsapQ8QZT2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms