Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Q3

Foxn4, Forkhead box protein N4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxn4Q8K3Q3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Foxn4Q8K3Q3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Foxn4Q8K3Q3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Foxn4Q8K3Q3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Foxn4Q8K3Q3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms