Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
OptnQ8K3K8 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
OptnQ8K3K8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
OptnQ8K3K8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
OptnQ8K3K8 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OptnQ8K3K8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
OptnQ8K3K8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OptnQ8K3K8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OptnQ8K3K8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
OptnQ8K3K8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OptnQ8K3K8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OptnQ8K3K8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OptnQ8K3K8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OptnQ8K3K8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OptnQ8K3K8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
OptnQ8K3K8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
OptnQ8K3K8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms