Protein–RNA interactions for Protein: Q8K341

Atat1, Alpha-tubulin N-acetyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atat1Q8K341 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atat1Q8K341 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atat1Q8K341 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atat1Q8K341 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atat1Q8K341 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atat1Q8K341 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atat1Q8K341 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atat1Q8K341 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atat1Q8K341 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atat1Q8K341 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atat1Q8K341 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atat1Q8K341 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms