Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Trappc12Q8K2L8 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trappc12Q8K2L8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Trappc12Q8K2L8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trappc12Q8K2L8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trappc12Q8K2L8 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms