Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I1

Fntb, Protein farnesyltransferase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FntbQ8K2I1 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FntbQ8K2I1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
FntbQ8K2I1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FntbQ8K2I1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms